Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC37.3■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
ERCC6Q03468 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC37.26■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC37.21■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ERCC6Q03468 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms