Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms