Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms