Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EXOSC10Q01780 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EXOSC10Q01780 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms