Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRCDQ00LT1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms