Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDC42EP1Q00587 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms