Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF2BQ00403 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2BQ00403 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms