Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDLBPQ00341 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDLBPQ00341 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms