Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
EFNB1P98172 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms