Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IRX6P78412 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
IRX6P78412 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IRX6P78412 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
IRX6P78412 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IRX6P78412 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IRX6P78412 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IRX6P78412 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IRX6P78412 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IRX6P78412 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IRX6P78412 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IRX6P78412 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IRX6P78412 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IRX6P78412 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IRX6P78412 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IRX6P78412 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IRX6P78412 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IRX6P78412 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IRX6P78412 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IRX6P78412 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IRX6P78412 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IRX6P78412 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IRX6P78412 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IRX6P78412 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IRX6P78412 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IRX6P78412 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IRX6P78412 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IRX6P78412 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IRX6P78412 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IRX6P78412 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IRX6P78412 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IRX6P78412 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IRX6P78412 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IRX6P78412 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IRX6P78412 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IRX6P78412 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IRX6P78412 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IRX6P78412 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IRX6P78412 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IRX6P78412 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IRX6P78412 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IRX6P78412 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IRX6P78412 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IRX6P78412 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRX6P78412 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRX6P78412 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRX6P78412 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRX6P78412 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRX6P78412 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRX6P78412 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRX6P78412 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRX6P78412 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRX6P78412 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRX6P78412 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRX6P78412 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRX6P78412 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRX6P78412 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IRX6P78412 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IRX6P78412 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IRX6P78412 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IRX6P78412 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IRX6P78412 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IRX6P78412 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IRX6P78412 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IRX6P78412 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IRX6P78412 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IRX6P78412 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IRX6P78412 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IRX6P78412 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IRX6P78412 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IRX6P78412 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IRX6P78412 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
IRX6P78412 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
IRX6P78412 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
IRX6P78412 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
IRX6P78412 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IRX6P78412 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IRX6P78412 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IRX6P78412 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IRX6P78412 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IRX6P78412 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IRX6P78412 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IRX6P78412 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IRX6P78412 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IRX6P78412 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IRX6P78412 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
IRX6P78412 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IRX6P78412 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
IRX6P78412 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IRX6P78412 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IRX6P78412 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IRX6P78412 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IRX6P78412 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IRX6P78412 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IRX6P78412 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IRX6P78412 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IRX6P78412 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IRX6P78412 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IRX6P78412 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IRX6P78412 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms