Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP2P78314 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP2P78314 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP2P78314 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP2P78314 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP2P78314 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP2P78314 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP2P78314 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP2P78314 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP2P78314 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP2P78314 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP2P78314 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP2P78314 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP2P78314 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP2P78314 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP2P78314 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP2P78314 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP2P78314 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SH3BP2P78314 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SH3BP2P78314 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SH3BP2P78314 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SH3BP2P78314 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3BP2P78314 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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