Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPM4P67936 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPM4P67936 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TPM4P67936 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TPM4P67936 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPM4P67936 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPM4P67936 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPM4P67936 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPM4P67936 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPM4P67936 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPM4P67936 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPM4P67936 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPM4P67936 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPM4P67936 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPM4P67936 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPM4P67936 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPM4P67936 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPM4P67936 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPM4P67936 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TPM4P67936 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TPM4P67936 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TPM4P67936 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TPM4P67936 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TPM4P67936 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TPM4P67936 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TPM4P67936 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPM4P67936 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPM4P67936 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TPM4P67936 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPM4P67936 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPM4P67936 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPM4P67936 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPM4P67936 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPM4P67936 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPM4P67936 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPM4P67936 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPM4P67936 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPM4P67936 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPM4P67936 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPM4P67936 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPM4P67936 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPM4P67936 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPM4P67936 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPM4P67936 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPM4P67936 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPM4P67936 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPM4P67936 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPM4P67936 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPM4P67936 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TPM4P67936 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPM4P67936 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPM4P67936 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPM4P67936 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPM4P67936 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPM4P67936 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPM4P67936 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPM4P67936 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPM4P67936 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPM4P67936 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPM4P67936 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPM4P67936 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPM4P67936 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPM4P67936 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPM4P67936 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPM4P67936 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPM4P67936 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPM4P67936 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPM4P67936 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPM4P67936 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPM4P67936 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPM4P67936 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPM4P67936 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TPM4P67936 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPM4P67936 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPM4P67936 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPM4P67936 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPM4P67936 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPM4P67936 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPM4P67936 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPM4P67936 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPM4P67936 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPM4P67936 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPM4P67936 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPM4P67936 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPM4P67936 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPM4P67936 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPM4P67936 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPM4P67936 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPM4P67936 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TPM4P67936 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPM4P67936 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPM4P67936 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPM4P67936 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPM4P67936 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPM4P67936 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPM4P67936 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPM4P67936 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPM4P67936 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPM4P67936 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPM4P67936 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms