Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNRPNP63162 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNRPNP63162 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNRPNP63162 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNRPNP63162 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNRPNP63162 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNRPNP63162 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNRPNP63162 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNRPNP63162 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNRPNP63162 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNRPNP63162 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms