Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RPS29P62273 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RPS29P62273 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RPS29P62273 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RPS29P62273 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RPS29P62273 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RPS29P62273 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RPS29P62273 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RPS29P62273 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RPS29P62273 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RPS29P62273 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RPS29P62273 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RPS29P62273 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RPS29P62273 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RPS29P62273 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RPS29P62273 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RPS29P62273 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RPS29P62273 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RPS29P62273 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RPS29P62273 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RPS29P62273 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RPS29P62273 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RPS29P62273 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RPS29P62273 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RPS29P62273 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RPS29P62273 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RPS29P62273 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RPS29P62273 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RPS29P62273 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RPS29P62273 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RPS29P62273 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RPS29P62273 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RPS29P62273 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RPS29P62273 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RPS29P62273 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RPS29P62273 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RPS29P62273 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RPS29P62273 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RPS29P62273 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RPS29P62273 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RPS29P62273 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RPS29P62273 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RPS29P62273 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RPS29P62273 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RPS29P62273 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RPS29P62273 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RPS29P62273 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RPS29P62273 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RPS29P62273 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RPS29P62273 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RPS29P62273 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RPS29P62273 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RPS29P62273 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
RPS29P62273 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RPS29P62273 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RPS29P62273 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RPS29P62273 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RPS29P62273 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RPS29P62273 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RPS29P62273 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RPS29P62273 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RPS29P62273 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RPS29P62273 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
RPS29P62273 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RPS29P62273 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RPS29P62273 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RPS29P62273 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RPS29P62273 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RPS29P62273 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
RPS29P62273 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RPS29P62273 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RPS29P62273 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RPS29P62273 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RPS29P62273 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RPS29P62273 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RPS29P62273 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
RPS29P62273 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RPS29P62273 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RPS29P62273 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RPS29P62273 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RPS29P62273 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RPS29P62273 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RPS29P62273 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RPS29P62273 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RPS29P62273 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RPS29P62273 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RPS29P62273 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
RPS29P62273 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RPS29P62273 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RPS29P62273 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RPS29P62273 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RPS29P62273 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RPS29P62273 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RPS29P62273 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RPS29P62273 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RPS29P62273 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RPS29P62273 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RPS29P62273 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RPS29P62273 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RPS29P62273 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
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