Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBE2HP62256 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2HP62256 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms