Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP46P62068 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP46P62068 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP46P62068 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP46P62068 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP46P62068 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP46P62068 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP46P62068 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP46P62068 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP46P62068 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP46P62068 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP46P62068 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP46P62068 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP46P62068 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP46P62068 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP46P62068 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP46P62068 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP46P62068 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP46P62068 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP46P62068 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP46P62068 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP46P62068 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP46P62068 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP46P62068 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP46P62068 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP46P62068 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP46P62068 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP46P62068 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP46P62068 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP46P62068 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP46P62068 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP46P62068 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP46P62068 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP46P62068 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USP46P62068 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP46P62068 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP46P62068 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USP46P62068 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP46P62068 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP46P62068 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USP46P62068 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP46P62068 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP46P62068 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP46P62068 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP46P62068 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP46P62068 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP46P62068 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP46P62068 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP46P62068 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP46P62068 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP46P62068 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP46P62068 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP46P62068 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP46P62068 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP46P62068 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP46P62068 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP46P62068 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP46P62068 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP46P62068 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP46P62068 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP46P62068 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP46P62068 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP46P62068 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP46P62068 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP46P62068 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP46P62068 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP46P62068 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP46P62068 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP46P62068 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP46P62068 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP46P62068 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP46P62068 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP46P62068 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP46P62068 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP46P62068 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
USP46P62068 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP46P62068 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP46P62068 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP46P62068 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
USP46P62068 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP46P62068 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP46P62068 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP46P62068 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP46P62068 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP46P62068 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP46P62068 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP46P62068 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP46P62068 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP46P62068 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP46P62068 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP46P62068 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP46P62068 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP46P62068 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP46P62068 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP46P62068 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP46P62068 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP46P62068 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP46P62068 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP46P62068 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP46P62068 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms