Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP1S1P61966 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP1S1P61966 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP1S1P61966 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP1S1P61966 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP1S1P61966 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP1S1P61966 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP1S1P61966 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP1S1P61966 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP1S1P61966 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP1S1P61966 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP1S1P61966 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP1S1P61966 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP1S1P61966 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
AP1S1P61966 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP1S1P61966 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP1S1P61966 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP1S1P61966 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP1S1P61966 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP1S1P61966 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP1S1P61966 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP1S1P61966 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP1S1P61966 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP1S1P61966 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP1S1P61966 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP1S1P61966 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP1S1P61966 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP1S1P61966 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP1S1P61966 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP1S1P61966 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP1S1P61966 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP1S1P61966 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP1S1P61966 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP1S1P61966 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP1S1P61966 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
AP1S1P61966 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP1S1P61966 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms