Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UFM1P61960 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UFM1P61960 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UFM1P61960 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UFM1P61960 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UFM1P61960 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UFM1P61960 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UFM1P61960 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UFM1P61960 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UFM1P61960 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
UFM1P61960 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
UFM1P61960 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UFM1P61960 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UFM1P61960 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UFM1P61960 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UFM1P61960 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UFM1P61960 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UFM1P61960 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
UFM1P61960 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UFM1P61960 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UFM1P61960 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UFM1P61960 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UFM1P61960 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UFM1P61960 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UFM1P61960 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UFM1P61960 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UFM1P61960 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UFM1P61960 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UFM1P61960 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UFM1P61960 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UFM1P61960 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
UFM1P61960 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UFM1P61960 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UFM1P61960 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UFM1P61960 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UFM1P61960 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UFM1P61960 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UFM1P61960 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UFM1P61960 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UFM1P61960 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UFM1P61960 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UFM1P61960 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UFM1P61960 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UFM1P61960 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UFM1P61960 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UFM1P61960 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UFM1P61960 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UFM1P61960 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UFM1P61960 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UFM1P61960 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UFM1P61960 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UFM1P61960 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UFM1P61960 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
UFM1P61960 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UFM1P61960 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UFM1P61960 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UFM1P61960 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UFM1P61960 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UFM1P61960 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UFM1P61960 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UFM1P61960 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UFM1P61960 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UFM1P61960 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
UFM1P61960 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UFM1P61960 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UFM1P61960 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UFM1P61960 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UFM1P61960 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UFM1P61960 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UFM1P61960 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UFM1P61960 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UFM1P61960 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
UFM1P61960 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UFM1P61960 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UFM1P61960 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UFM1P61960 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
UFM1P61960 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UFM1P61960 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UFM1P61960 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UFM1P61960 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UFM1P61960 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UFM1P61960 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UFM1P61960 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UFM1P61960 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UFM1P61960 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UFM1P61960 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UFM1P61960 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UFM1P61960 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UFM1P61960 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UFM1P61960 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UFM1P61960 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UFM1P61960 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UFM1P61960 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UFM1P61960 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UFM1P61960 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UFM1P61960 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UFM1P61960 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UFM1P61960 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UFM1P61960 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UFM1P61960 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms