Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DEFA3P59666 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms