Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NLRP6P59044 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms