Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX9P55771 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX9P55771 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX9P55771 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX9P55771 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX9P55771 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX9P55771 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX9P55771 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX9P55771 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX9P55771 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX9P55771 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX9P55771 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX9P55771 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX9P55771 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX9P55771 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX9P55771 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX9P55771 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX9P55771 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX9P55771 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX9P55771 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX9P55771 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX9P55771 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX9P55771 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX9P55771 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX9P55771 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX9P55771 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX9P55771 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX9P55771 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX9P55771 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX9P55771 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX9P55771 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX9P55771 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX9P55771 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX9P55771 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX9P55771 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX9P55771 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX9P55771 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX9P55771 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX9P55771 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX9P55771 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX9P55771 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX9P55771 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX9P55771 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX9P55771 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX9P55771 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX9P55771 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX9P55771 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX9P55771 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX9P55771 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX9P55771 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX9P55771 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX9P55771 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX9P55771 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX9P55771 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX9P55771 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX9P55771 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX9P55771 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX9P55771 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX9P55771 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX9P55771 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX9P55771 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX9P55771 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX9P55771 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX9P55771 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX9P55771 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX9P55771 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX9P55771 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX9P55771 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX9P55771 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX9P55771 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX9P55771 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX9P55771 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX9P55771 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX9P55771 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX9P55771 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX9P55771 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX9P55771 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX9P55771 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX9P55771 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX9P55771 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX9P55771 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX9P55771 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX9P55771 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX9P55771 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX9P55771 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX9P55771 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX9P55771 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX9P55771 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX9P55771 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX9P55771 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX9P55771 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX9P55771 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX9P55771 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX9P55771 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX9P55771 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX9P55771 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX9P55771 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX9P55771 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX9P55771 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX9P55771 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms