Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH8P55286 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH8P55286 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH8P55286 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH8P55286 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH8P55286 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH8P55286 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH8P55286 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH8P55286 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH8P55286 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH8P55286 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH8P55286 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH8P55286 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH8P55286 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH8P55286 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH8P55286 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH8P55286 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH8P55286 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH8P55286 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH8P55286 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH8P55286 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH8P55286 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH8P55286 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH8P55286 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH8P55286 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH8P55286 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH8P55286 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH8P55286 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH8P55286 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH8P55286 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH8P55286 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH8P55286 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH8P55286 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH8P55286 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH8P55286 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH8P55286 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH8P55286 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH8P55286 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH8P55286 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH8P55286 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH8P55286 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH8P55286 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH8P55286 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH8P55286 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH8P55286 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH8P55286 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH8P55286 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH8P55286 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH8P55286 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH8P55286 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH8P55286 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH8P55286 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH8P55286 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH8P55286 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH8P55286 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH8P55286 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH8P55286 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH8P55286 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH8P55286 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH8P55286 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH8P55286 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH8P55286 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH8P55286 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH8P55286 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH8P55286 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH8P55286 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH8P55286 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH8P55286 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH8P55286 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH8P55286 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH8P55286 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH8P55286 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH8P55286 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH8P55286 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH8P55286 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH8P55286 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH8P55286 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH8P55286 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH8P55286 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH8P55286 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH8P55286 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH8P55286 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH8P55286 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH8P55286 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH8P55286 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH8P55286 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH8P55286 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH8P55286 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH8P55286 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH8P55286 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH8P55286 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH8P55286 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH8P55286 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH8P55286 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH8P55286 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH8P55286 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH8P55286 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH8P55286 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH8P55286 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH8P55286 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms