Protein–RNA interactions for Protein: P55072

VCP, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPP55072 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VCPP55072 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCPP55072 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCPP55072 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCPP55072 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCPP55072 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCPP55072 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCPP55072 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCPP55072 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VCPP55072 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCPP55072 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCPP55072 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCPP55072 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCPP55072 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCPP55072 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCPP55072 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCPP55072 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCPP55072 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VCPP55072 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCPP55072 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCPP55072 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCPP55072 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCPP55072 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCPP55072 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCPP55072 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCPP55072 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCPP55072 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VCPP55072 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCPP55072 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCPP55072 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCPP55072 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VCPP55072 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCPP55072 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCPP55072 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCPP55072 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCPP55072 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCPP55072 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCPP55072 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCPP55072 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCPP55072 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCPP55072 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCPP55072 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCPP55072 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCPP55072 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCPP55072 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCPP55072 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VCPP55072 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCPP55072 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCPP55072 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCPP55072 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCPP55072 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCPP55072 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VCPP55072 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCPP55072 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCPP55072 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCPP55072 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCPP55072 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCPP55072 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCPP55072 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCPP55072 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCPP55072 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCPP55072 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCPP55072 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCPP55072 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCPP55072 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VCPP55072 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCPP55072 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCPP55072 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCPP55072 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCPP55072 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCPP55072 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCPP55072 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VCPP55072 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VCPP55072 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCPP55072 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCPP55072 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCPP55072 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCPP55072 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCPP55072 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCPP55072 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCPP55072 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCPP55072 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCPP55072 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCPP55072 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCPP55072 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCPP55072 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCPP55072 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCPP55072 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCPP55072 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCPP55072 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCPP55072 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCPP55072 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCPP55072 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCPP55072 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCPP55072 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCPP55072 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCPP55072 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCPP55072 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VCPP55072 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VCPP55072 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms