Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EMP1P54849 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EMP1P54849 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EMP1P54849 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EMP1P54849 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EMP1P54849 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EMP1P54849 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EMP1P54849 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EMP1P54849 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EMP1P54849 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EMP1P54849 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EMP1P54849 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EMP1P54849 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EMP1P54849 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EMP1P54849 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EMP1P54849 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EMP1P54849 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EMP1P54849 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EMP1P54849 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EMP1P54849 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EMP1P54849 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EMP1P54849 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EMP1P54849 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EMP1P54849 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EMP1P54849 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EMP1P54849 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EMP1P54849 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EMP1P54849 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EMP1P54849 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EMP1P54849 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EMP1P54849 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EMP1P54849 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EMP1P54849 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EMP1P54849 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EMP1P54849 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EMP1P54849 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EMP1P54849 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EMP1P54849 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EMP1P54849 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EMP1P54849 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EMP1P54849 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EMP1P54849 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EMP1P54849 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EMP1P54849 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EMP1P54849 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EMP1P54849 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EMP1P54849 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EMP1P54849 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EMP1P54849 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EMP1P54849 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EMP1P54849 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EMP1P54849 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMP1P54849 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMP1P54849 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMP1P54849 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMP1P54849 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMP1P54849 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMP1P54849 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMP1P54849 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMP1P54849 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMP1P54849 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EMP1P54849 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMP1P54849 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMP1P54849 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMP1P54849 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMP1P54849 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMP1P54849 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMP1P54849 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMP1P54849 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMP1P54849 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EMP1P54849 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EMP1P54849 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EMP1P54849 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EMP1P54849 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMP1P54849 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMP1P54849 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMP1P54849 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMP1P54849 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EMP1P54849 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMP1P54849 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMP1P54849 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMP1P54849 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMP1P54849 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMP1P54849 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMP1P54849 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMP1P54849 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMP1P54849 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EMP1P54849 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EMP1P54849 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EMP1P54849 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EMP1P54849 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EMP1P54849 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EMP1P54849 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EMP1P54849 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EMP1P54849 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EMP1P54849 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EMP1P54849 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EMP1P54849 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EMP1P54849 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EMP1P54849 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms