Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NRLP54845 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRLP54845 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRLP54845 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRLP54845 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRLP54845 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRLP54845 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRLP54845 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRLP54845 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRLP54845 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRLP54845 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NRLP54845 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NRLP54845 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NRLP54845 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRLP54845 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NRLP54845 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRLP54845 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRLP54845 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRLP54845 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRLP54845 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRLP54845 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NRLP54845 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NRLP54845 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRLP54845 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRLP54845 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRLP54845 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRLP54845 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRLP54845 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRLP54845 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NRLP54845 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRLP54845 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRLP54845 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRLP54845 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NRLP54845 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRLP54845 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRLP54845 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRLP54845 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRLP54845 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRLP54845 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRLP54845 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRLP54845 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRLP54845 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRLP54845 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRLP54845 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRLP54845 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NRLP54845 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRLP54845 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRLP54845 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRLP54845 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRLP54845 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRLP54845 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRLP54845 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRLP54845 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRLP54845 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRLP54845 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NRLP54845 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRLP54845 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRLP54845 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRLP54845 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRLP54845 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRLP54845 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRLP54845 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NRLP54845 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRLP54845 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRLP54845 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRLP54845 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRLP54845 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRLP54845 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRLP54845 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRLP54845 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRLP54845 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NRLP54845 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRLP54845 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRLP54845 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRLP54845 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRLP54845 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NRLP54845 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRLP54845 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRLP54845 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NRLP54845 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRLP54845 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRLP54845 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRLP54845 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NRLP54845 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRLP54845 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRLP54845 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRLP54845 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NRLP54845 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRLP54845 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRLP54845 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRLP54845 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRLP54845 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRLP54845 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRLP54845 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRLP54845 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRLP54845 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRLP54845 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRLP54845 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRLP54845 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRLP54845 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms