Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHB4P54760 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms