Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RARSP54136 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RARSP54136 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RARSP54136 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RARSP54136 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RARSP54136 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RARSP54136 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RARSP54136 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RARSP54136 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RARSP54136 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RARSP54136 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RARSP54136 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RARSP54136 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RARSP54136 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RARSP54136 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RARSP54136 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RARSP54136 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RARSP54136 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
RARSP54136 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RARSP54136 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RARSP54136 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
RARSP54136 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.51■■■□□ 2
RARSP54136 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RARSP54136 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RARSP54136 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RARSP54136 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RARSP54136 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RARSP54136 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RARSP54136 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RARSP54136 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RARSP54136 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RARSP54136 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RARSP54136 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RARSP54136 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RARSP54136 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RARSP54136 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RARSP54136 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RARSP54136 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RARSP54136 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RARSP54136 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RARSP54136 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RARSP54136 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RARSP54136 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RARSP54136 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RARSP54136 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RARSP54136 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RARSP54136 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RARSP54136 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RARSP54136 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RARSP54136 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RARSP54136 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RARSP54136 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RARSP54136 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RARSP54136 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RARSP54136 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RARSP54136 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RARSP54136 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RARSP54136 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RARSP54136 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RARSP54136 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RARSP54136 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RARSP54136 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RARSP54136 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RARSP54136 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RARSP54136 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RARSP54136 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RARSP54136 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RARSP54136 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RARSP54136 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RARSP54136 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RARSP54136 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RARSP54136 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RARSP54136 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RARSP54136 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RARSP54136 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RARSP54136 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RARSP54136 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RARSP54136 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RARSP54136 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RARSP54136 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RARSP54136 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RARSP54136 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RARSP54136 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RARSP54136 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RARSP54136 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RARSP54136 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RARSP54136 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RARSP54136 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RARSP54136 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RARSP54136 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RARSP54136 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RARSP54136 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RARSP54136 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RARSP54136 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RARSP54136 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RARSP54136 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RARSP54136 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RARSP54136 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RARSP54136 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RARSP54136 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms