Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP3M2P53677 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms