Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDST1P52848 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NDST1P52848 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDST1P52848 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDST1P52848 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDST1P52848 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDST1P52848 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDST1P52848 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDST1P52848 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDST1P52848 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDST1P52848 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDST1P52848 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDST1P52848 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDST1P52848 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDST1P52848 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDST1P52848 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDST1P52848 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDST1P52848 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDST1P52848 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDST1P52848 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDST1P52848 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDST1P52848 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDST1P52848 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDST1P52848 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NDST1P52848 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDST1P52848 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDST1P52848 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDST1P52848 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDST1P52848 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDST1P52848 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDST1P52848 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDST1P52848 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDST1P52848 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDST1P52848 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDST1P52848 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDST1P52848 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDST1P52848 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDST1P52848 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDST1P52848 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDST1P52848 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NDST1P52848 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDST1P52848 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDST1P52848 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDST1P52848 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDST1P52848 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDST1P52848 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDST1P52848 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDST1P52848 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDST1P52848 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDST1P52848 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDST1P52848 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDST1P52848 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDST1P52848 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDST1P52848 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDST1P52848 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDST1P52848 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDST1P52848 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDST1P52848 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDST1P52848 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDST1P52848 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDST1P52848 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDST1P52848 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NDST1P52848 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDST1P52848 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDST1P52848 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDST1P52848 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDST1P52848 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDST1P52848 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NDST1P52848 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDST1P52848 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDST1P52848 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NDST1P52848 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDST1P52848 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NDST1P52848 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDST1P52848 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDST1P52848 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDST1P52848 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDST1P52848 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDST1P52848 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDST1P52848 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDST1P52848 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDST1P52848 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDST1P52848 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDST1P52848 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDST1P52848 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDST1P52848 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDST1P52848 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDST1P52848 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDST1P52848 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDST1P52848 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDST1P52848 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDST1P52848 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDST1P52848 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDST1P52848 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDST1P52848 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDST1P52848 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDST1P52848 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDST1P52848 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDST1P52848 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDST1P52848 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms