Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2A2P52657 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms