Protein–RNA interactions for Protein: P51825

AFF1, AF4/FMR2 family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF1P51825 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFF1P51825 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFF1P51825 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFF1P51825 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFF1P51825 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFF1P51825 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
AFF1P51825 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFF1P51825 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
AFF1P51825 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
AFF1P51825 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFF1P51825 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFF1P51825 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFF1P51825 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFF1P51825 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
AFF1P51825 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFF1P51825 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFF1P51825 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFF1P51825 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
AFF1P51825 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFF1P51825 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFF1P51825 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFF1P51825 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFF1P51825 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFF1P51825 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFF1P51825 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFF1P51825 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFF1P51825 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFF1P51825 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFF1P51825 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFF1P51825 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFF1P51825 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFF1P51825 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFF1P51825 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFF1P51825 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFF1P51825 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
AFF1P51825 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AFF1P51825 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AFF1P51825 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AFF1P51825 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFF1P51825 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFF1P51825 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFF1P51825 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFF1P51825 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFF1P51825 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFF1P51825 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
AFF1P51825 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFF1P51825 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFF1P51825 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFF1P51825 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFF1P51825 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFF1P51825 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFF1P51825 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFF1P51825 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFF1P51825 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFF1P51825 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFF1P51825 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFF1P51825 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFF1P51825 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFF1P51825 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFF1P51825 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AFF1P51825 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFF1P51825 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFF1P51825 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFF1P51825 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFF1P51825 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFF1P51825 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFF1P51825 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AFF1P51825 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AFF1P51825 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AFF1P51825 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AFF1P51825 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
AFF1P51825 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
AFF1P51825 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
AFF1P51825 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AFF1P51825 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AFF1P51825 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AFF1P51825 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AFF1P51825 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AFF1P51825 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AFF1P51825 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AFF1P51825 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AFF1P51825 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AFF1P51825 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AFF1P51825 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AFF1P51825 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AFF1P51825 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AFF1P51825 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AFF1P51825 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
AFF1P51825 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AFF1P51825 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AFF1P51825 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AFF1P51825 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AFF1P51825 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AFF1P51825 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AFF1P51825 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
AFF1P51825 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AFF1P51825 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AFF1P51825 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AFF1P51825 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AFF1P51825 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms