Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPOLAP51003 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAPOLAP51003 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAPOLAP51003 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAPOLAP51003 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAPOLAP51003 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAPOLAP51003 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAPOLAP51003 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAPOLAP51003 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPOLAP51003 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPOLAP51003 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPOLAP51003 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPOLAP51003 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPOLAP51003 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPOLAP51003 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPOLAP51003 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPOLAP51003 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPOLAP51003 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPOLAP51003 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPOLAP51003 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPOLAP51003 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPOLAP51003 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPOLAP51003 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPOLAP51003 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPOLAP51003 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPOLAP51003 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPOLAP51003 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPOLAP51003 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPOLAP51003 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPOLAP51003 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPOLAP51003 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPOLAP51003 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPOLAP51003 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPOLAP51003 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms