Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBP50607 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBP50607 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBP50607 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBP50607 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBP50607 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBP50607 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBP50607 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBP50607 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBP50607 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBP50607 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBP50607 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBP50607 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBP50607 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBP50607 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBP50607 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBP50607 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBP50607 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBP50607 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBP50607 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBP50607 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBP50607 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBP50607 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBP50607 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBP50607 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBP50607 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBP50607 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBP50607 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBP50607 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBP50607 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBP50607 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBP50607 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBP50607 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBP50607 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBP50607 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBP50607 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBP50607 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBP50607 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBP50607 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBP50607 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBP50607 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBP50607 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBP50607 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBP50607 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBP50607 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBP50607 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBP50607 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBP50607 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBP50607 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBP50607 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBP50607 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBP50607 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBP50607 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBP50607 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBP50607 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBP50607 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBP50607 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBP50607 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBP50607 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBP50607 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBP50607 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBP50607 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBP50607 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBP50607 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBP50607 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBP50607 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBP50607 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBP50607 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBP50607 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBP50607 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBP50607 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBP50607 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBP50607 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBP50607 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBP50607 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBP50607 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBP50607 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBP50607 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBP50607 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBP50607 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBP50607 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBP50607 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBP50607 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBP50607 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBP50607 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBP50607 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBP50607 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TUBP50607 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBP50607 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBP50607 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBP50607 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBP50607 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBP50607 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBP50607 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBP50607 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBP50607 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBP50607 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBP50607 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBP50607 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBP50607 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms