Protein–RNA interactions for Protein: P49682

CXCR3, C-X-C chemokine receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR3P49682 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR3P49682 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR3P49682 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR3P49682 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR3P49682 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR3P49682 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR3P49682 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR3P49682 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR3P49682 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CXCR3P49682 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CXCR3P49682 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR3P49682 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms