Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRIM1P49642 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms