Protein–RNA interactions for Protein: P49590

HARS2, Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARS2P49590 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HARS2P49590 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HARS2P49590 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HARS2P49590 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HARS2P49590 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HARS2P49590 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HARS2P49590 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HARS2P49590 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HARS2P49590 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HARS2P49590 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HARS2P49590 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HARS2P49590 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HARS2P49590 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HARS2P49590 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HARS2P49590 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HARS2P49590 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HARS2P49590 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HARS2P49590 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HARS2P49590 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HARS2P49590 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HARS2P49590 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HARS2P49590 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HARS2P49590 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HARS2P49590 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HARS2P49590 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HARS2P49590 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HARS2P49590 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HARS2P49590 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HARS2P49590 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HARS2P49590 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HARS2P49590 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HARS2P49590 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HARS2P49590 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HARS2P49590 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HARS2P49590 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HARS2P49590 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HARS2P49590 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HARS2P49590 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HARS2P49590 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HARS2P49590 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HARS2P49590 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HARS2P49590 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HARS2P49590 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HARS2P49590 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HARS2P49590 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HARS2P49590 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HARS2P49590 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HARS2P49590 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HARS2P49590 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HARS2P49590 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HARS2P49590 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HARS2P49590 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HARS2P49590 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HARS2P49590 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HARS2P49590 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HARS2P49590 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HARS2P49590 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HARS2P49590 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HARS2P49590 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HARS2P49590 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HARS2P49590 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HARS2P49590 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HARS2P49590 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HARS2P49590 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HARS2P49590 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HARS2P49590 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HARS2P49590 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HARS2P49590 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HARS2P49590 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HARS2P49590 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HARS2P49590 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HARS2P49590 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HARS2P49590 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HARS2P49590 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HARS2P49590 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HARS2P49590 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HARS2P49590 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HARS2P49590 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HARS2P49590 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HARS2P49590 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HARS2P49590 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HARS2P49590 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HARS2P49590 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HARS2P49590 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HARS2P49590 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HARS2P49590 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HARS2P49590 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HARS2P49590 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HARS2P49590 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HARS2P49590 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HARS2P49590 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HARS2P49590 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HARS2P49590 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HARS2P49590 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HARS2P49590 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HARS2P49590 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HARS2P49590 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HARS2P49590 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HARS2P49590 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HARS2P49590 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms