Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRCC3P46736 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRCC3P46736 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms