Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP5P45974 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP5P45974 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP5P45974 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP5P45974 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP5P45974 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP5P45974 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
USP5P45974 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP5P45974 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP5P45974 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP5P45974 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP5P45974 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP5P45974 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP5P45974 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP5P45974 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP5P45974 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
USP5P45974 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP5P45974 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP5P45974 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP5P45974 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP5P45974 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP5P45974 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP5P45974 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP5P45974 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP5P45974 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP5P45974 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP5P45974 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP5P45974 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP5P45974 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP5P45974 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP5P45974 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP5P45974 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP5P45974 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP5P45974 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP5P45974 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP5P45974 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP5P45974 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP5P45974 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP5P45974 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP5P45974 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP5P45974 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP5P45974 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP5P45974 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP5P45974 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
USP5P45974 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP5P45974 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP5P45974 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP5P45974 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP5P45974 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP5P45974 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP5P45974 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP5P45974 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP5P45974 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
USP5P45974 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP5P45974 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP5P45974 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP5P45974 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP5P45974 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP5P45974 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP5P45974 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP5P45974 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP5P45974 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
USP5P45974 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP5P45974 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP5P45974 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP5P45974 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
USP5P45974 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP5P45974 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP5P45974 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP5P45974 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP5P45974 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP5P45974 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP5P45974 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP5P45974 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP5P45974 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP5P45974 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP5P45974 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP5P45974 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP5P45974 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP5P45974 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP5P45974 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP5P45974 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP5P45974 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP5P45974 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP5P45974 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP5P45974 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP5P45974 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP5P45974 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP5P45974 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP5P45974 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP5P45974 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP5P45974 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP5P45974 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP5P45974 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP5P45974 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP5P45974 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP5P45974 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP5P45974 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP5P45974 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP5P45974 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms