Protein–RNA interactions for Protein: P43235

CTSK, Cathepsin K, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSKP43235 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CTSKP43235 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CTSKP43235 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTSKP43235 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTSKP43235 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTSKP43235 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTSKP43235 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTSKP43235 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTSKP43235 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTSKP43235 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTSKP43235 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTSKP43235 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CTSKP43235 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CTSKP43235 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTSKP43235 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTSKP43235 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CTSKP43235 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CTSKP43235 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTSKP43235 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTSKP43235 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTSKP43235 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTSKP43235 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTSKP43235 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSKP43235 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSKP43235 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSKP43235 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSKP43235 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSKP43235 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSKP43235 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSKP43235 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSKP43235 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSKP43235 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSKP43235 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSKP43235 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSKP43235 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSKP43235 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSKP43235 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSKP43235 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSKP43235 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSKP43235 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSKP43235 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSKP43235 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSKP43235 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSKP43235 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSKP43235 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSKP43235 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSKP43235 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSKP43235 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSKP43235 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSKP43235 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSKP43235 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSKP43235 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSKP43235 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSKP43235 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSKP43235 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSKP43235 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSKP43235 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSKP43235 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSKP43235 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSKP43235 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSKP43235 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSKP43235 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSKP43235 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSKP43235 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSKP43235 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSKP43235 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSKP43235 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSKP43235 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSKP43235 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSKP43235 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSKP43235 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSKP43235 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSKP43235 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSKP43235 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSKP43235 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSKP43235 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSKP43235 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSKP43235 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSKP43235 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSKP43235 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSKP43235 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSKP43235 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSKP43235 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSKP43235 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSKP43235 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSKP43235 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSKP43235 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSKP43235 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSKP43235 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSKP43235 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSKP43235 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSKP43235 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSKP43235 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSKP43235 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSKP43235 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSKP43235 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSKP43235 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSKP43235 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSKP43235 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTSKP43235 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms