Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms