Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms