Protein–RNA interactions for Protein: P35523

CLCN1, Chloride channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN1P35523 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN1P35523 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN1P35523 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN1P35523 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN1P35523 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN1P35523 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN1P35523 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN1P35523 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN1P35523 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN1P35523 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN1P35523 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN1P35523 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN1P35523 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN1P35523 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN1P35523 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN1P35523 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN1P35523 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN1P35523 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN1P35523 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN1P35523 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN1P35523 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN1P35523 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN1P35523 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN1P35523 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN1P35523 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN1P35523 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN1P35523 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN1P35523 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms