Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SFTPDP35247 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms