Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DSG3P32926 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DSG3P32926 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DSG3P32926 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DSG3P32926 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DSG3P32926 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSG3P32926 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSG3P32926 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSG3P32926 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSG3P32926 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSG3P32926 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSG3P32926 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSG3P32926 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSG3P32926 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSG3P32926 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSG3P32926 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSG3P32926 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSG3P32926 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSG3P32926 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSG3P32926 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSG3P32926 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSG3P32926 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSG3P32926 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSG3P32926 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DSG3P32926 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSG3P32926 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSG3P32926 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSG3P32926 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DSG3P32926 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSG3P32926 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSG3P32926 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSG3P32926 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSG3P32926 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSG3P32926 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSG3P32926 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSG3P32926 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSG3P32926 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DSG3P32926 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSG3P32926 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSG3P32926 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSG3P32926 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DSG3P32926 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DSG3P32926 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DSG3P32926 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSG3P32926 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSG3P32926 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSG3P32926 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSG3P32926 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSG3P32926 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSG3P32926 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSG3P32926 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSG3P32926 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSG3P32926 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSG3P32926 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSG3P32926 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSG3P32926 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSG3P32926 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSG3P32926 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSG3P32926 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSG3P32926 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSG3P32926 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSG3P32926 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSG3P32926 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSG3P32926 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DSG3P32926 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSG3P32926 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSG3P32926 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSG3P32926 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSG3P32926 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSG3P32926 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSG3P32926 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSG3P32926 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSG3P32926 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSG3P32926 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DSG3P32926 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSG3P32926 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSG3P32926 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSG3P32926 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSG3P32926 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSG3P32926 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSG3P32926 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSG3P32926 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSG3P32926 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSG3P32926 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSG3P32926 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DSG3P32926 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSG3P32926 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSG3P32926 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSG3P32926 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSG3P32926 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DSG3P32926 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSG3P32926 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DSG3P32926 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DSG3P32926 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DSG3P32926 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DSG3P32926 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DSG3P32926 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DSG3P32926 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
DSG3P32926 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DSG3P32926 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms