Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms