Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXA7P31268 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA7P31268 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms