Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TM4SF1P30408 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms