Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms