Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCSK1P29120 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms