Protein–RNA interactions for Protein: P27824

CANX, Calnexin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CANXP27824 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CANXP27824 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CANXP27824 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CANXP27824 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CANXP27824 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CANXP27824 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CANXP27824 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CANXP27824 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CANXP27824 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CANXP27824 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CANXP27824 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CANXP27824 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CANXP27824 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CANXP27824 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CANXP27824 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CANXP27824 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CANXP27824 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CANXP27824 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CANXP27824 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CANXP27824 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CANXP27824 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CANXP27824 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CANXP27824 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CANXP27824 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CANXP27824 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CANXP27824 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CANXP27824 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CANXP27824 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CANXP27824 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CANXP27824 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CANXP27824 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CANXP27824 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CANXP27824 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CANXP27824 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CANXP27824 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CANXP27824 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CANXP27824 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CANXP27824 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CANXP27824 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CANXP27824 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CANXP27824 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CANXP27824 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CANXP27824 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CANXP27824 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CANXP27824 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CANXP27824 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CANXP27824 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CANXP27824 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CANXP27824 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CANXP27824 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CANXP27824 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CANXP27824 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CANXP27824 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CANXP27824 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CANXP27824 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CANXP27824 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CANXP27824 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CANXP27824 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CANXP27824 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CANXP27824 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CANXP27824 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CANXP27824 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CANXP27824 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CANXP27824 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CANXP27824 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CANXP27824 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CANXP27824 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CANXP27824 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CANXP27824 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CANXP27824 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CANXP27824 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CANXP27824 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CANXP27824 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CANXP27824 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CANXP27824 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CANXP27824 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CANXP27824 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CANXP27824 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CANXP27824 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CANXP27824 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CANXP27824 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CANXP27824 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CANXP27824 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CANXP27824 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CANXP27824 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CANXP27824 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CANXP27824 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CANXP27824 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CANXP27824 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CANXP27824 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CANXP27824 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CANXP27824 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CANXP27824 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CANXP27824 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CANXP27824 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CANXP27824 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CANXP27824 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CANXP27824 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CANXP27824 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CANXP27824 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms